banner
Дом / Блог / Идентификация клеткой нового агониста рецептора гиббереллина, дифегарактина
Блог

Идентификация клеткой нового агониста рецептора гиббереллина, дифегарактина

Mar 16, 2023Mar 16, 2023

Биология связи, том 6, Номер статьи: 448 (2023) Цитировать эту статью

593 доступа

6 Альтметрика

Подробности о метриках

Гиббереллин (ГА) – фитогормон, регулирующий различные процессы развития в течение жизненного цикла растений. В этом исследовании мы идентифицируем новый агонист GA, дифегарактин, используя систему скрининга лекарств на основе бесклеточной пшеницы с рецептором GA винограда. Система анализа GA-зависимого взаимодействия с использованием рецепторов GA и белков DELLA из Vitis vinifera была создана с использованием технологии AlphaScreen и белков, полученных бесклеточным способом. Из библиотеки химических соединений было обнаружено, что дифегарактин усиливает взаимодействие между рецепторами GA и белками DELLA винограда in vitro. В винограде мы обнаружили, что дифегарактин вызывает удлинение грозди и увеличивает концентрацию сахара в ягодах винограда. Кроме того, дифегарактин проявляет GA-подобную активность, включая содействие удлинению корней у салата и арабидопсиса, а также уменьшение пигментации кожуры и подавление вздутия кожуры у цитрусовых. Насколько нам известно, это исследование является первым, в котором удалось успешно идентифицировать агонист рецептора GA, проявляющий GA-подобную активность в сельскохозяйственных растениях, с использованием системы молекулярно-направленного скрининга лекарств in vitro.

Гиббереллин (ГК) – фитогормон, вырабатываемый растениями и некоторыми микроорганизмами, включая грибы и бактерии, который регулирует широкий спектр процессов развития на протяжении всего жизненного цикла растений1. Хотя ГК составляют группу из более чем 100 структурно родственных соединений, содержащих энт-гиббереллановый скелет, только некоторые ГК, такие как GA1, GA3, GA4 и GA7 (рис. 1а), обладают биологической активностью2. GA1, GA4 и GA7 являются основными природными биоактивными ГК, а GA3 является вторичным метаболитом гриба Gibberella fujikuroi3. Органический синтез природных биоактивных ГК затруднен сложными производственными процессами2. GA3, выделенный из грибов, широко используется в области сельского хозяйства и садоводства в качестве регулятора роста растений. Таким образом, GA3 является единственным GA, в котором метод производства основан на глубинной ферментации.

Структуры ГА. б Принцип анализа взаимодействия между GID1 и DELLA с использованием системы AlphaScreen. Биотинилированный белок GID1 связывается со стрептавидином на донорских шариках с чрезвычайно специфичной и высокой аффинностью. Покрытые белком А акцепторные шарики объединяли с меченным FLAG белком DELLA с использованием антитела против FLAG. Комплекс GID1-DELLA образует большой комплекс с двумя типами шариков через антитело и стрептавидин. После освещения при длине волны 680 нм шарик-донор преобразует кислород окружающей среды в синглетный кислород, а синглетный кислород переносится для активации шарика-акцептора и впоследствии излучает свет с длиной волны 520–620 нм. в Синтез белков VvGID и VvDELLA. Биотинилированные белки VvGID1 и меченные FLAG VvDELLA синтезировали с использованием бесклеточной системы пшеницы. Синтез этих белков был подтвержден иммуноблоттингом с использованием антител против биотина и против FLAG. d Анализ взаимодействия между белками VvGID1a и VvDELLA. Взаимодействие VvGID1a с белками VvDELLA анализировали с помощью системы AlphaScreen с использованием ГК в различных концентрациях. Данные показаны как средние и отдельные точки данных из трех независимых экспериментов. e Анализ взаимодействия между белками VvGID1b и VvDELLA. Взаимодействие VvGID1b с белками VvDELLA анализировали с помощью системы AlphaScreen с использованием ГК в различных концентрациях. Данные показаны как средние и отдельные точки данных из трех независимых экспериментов.

В качестве типичного применения в сельском хозяйстве GA3 широко используется для стимулирования прорастания семян, удлинения стебля, цветения, созревания плодов и производства бессемянных плодов4,5. Однако эффекты GA3 часто зависят от вида растения6. В случае винограда без косточек GA3 не может вызвать бессемянный признак у некоторых сортов. Хотя причина этого неуловима, возможным объяснением может быть катаболизм растительных ферментов. Фактически, 2,2-диметил GA4, который не катаболизируется GA 2-оксидазами, ферментами инактивации GA, продемонстрировал высокую и непрерывную активность удлинения стебля у риса и кукурузы7. Следовательно, агонисты ГА, имеющие структуру, отличную от ГА, могут быть эффективны даже в этих случаях. Поскольку агонисты ГК, не имеющие энт-гибберелланового скелета, все еще ограничены (AC-943778, 67D9, аналог гельминтоспоровой кислоты10), в мировой сельскохозяйственной отрасли ожидается разработка новых агонистов ГК со структурой, отличной от ГК.

1) and downregulated (log2 fold change < ‒1) genes by GA3-treatment. The coefficient of determination (R2) between GA3 and diphegaractin was calculated and indicated in the figure. b Venn diagrams showing the overlap of upregulated (log2 fold change >1) and downregulated (log2 fold change < ‒1) genes between GA3 and diphegaractin treatments. c Gene ontology analysis of differentially expressed genes. Gene ontological analysis of 1260 upregulated genes and 765 downregulated genes was performed. Enriched biological processes are listed based on their p values./p>1) by GA3-treatment were AtGA2ox2 (1.1) and AtGA2ox6 (2.9). In these genes, AtGA20ox3 was also similar level downregulated by diphegaractin (−2.3), indicating feedback regulation of AtGA20ox3 by GA would be mediated by AtGID1b/AtRGA, AtGID1c/AtRGA, and/or AtGID1c/AtGAI. Whereas, expression level of AtGA20ox2, AtGA3ox1, AtGA3ox2, and AtGA2ox6 were hardly affected by diphegaractin-treatment (1 > log2 fold change > −1). In contrast, AtGA2ox2 was upregulated by GA3 (1.1) but downregulated by diphagaractin (−3.0). These results indicate that the expression levels of most of GA synthetic and metabolic genes seem not to be affected by diphegaractin. The response of these genes to GA would be mediated by the combinations of GID1 and DELLA proteins except for AtGID1b/AtRGA, AtGID1c/AtRGA, and AtGID1c/AtGAI./p>1 or <‒1) were annotated by the Arabidopsis Genome Initiative (AGI) locus codes, and were analysed for gene ontology. Gene ontology biological process enrichment analysis was performed using the PANTHER Classification System analysis tool on the homepage of the GOC website (http://geneontology.org). After gene ontology analysis, biological processes consisting of 50–999 annotated genes were selected. Biological processes with scores more than 4.2 (‒log10 (p value)) are shown in Fig. 6c./p>